dolor intenso rodillas, me cuesta hacer ejercicio correr, que puede ser

Hola. Tengo 23 años y el pie plano,me gusta hacer ejercicio y correr, pero cuando corro distancias muy largas como maratones, las rodillas empiezan a dolerme tanto que me cuesta caminar, el dolor es intenso y del lado exterior de ambas rodillas. Quisiera saber a que podrí­a deberse?... si requiero de algún tipo de tenis especial, plantillas o de plano tengo que ir a un ortopedista o médico del deporte para que me diagnostique.

Gracias!